Ich hab den Ordner "Skyrim" meines Wissens nach nicht, müsste ich mal nachschauen, aber gut, dann sollte das auch nirgendwo negativ mit reinspielen, wenn es nur .ini Kopien sind.
Das mit dem Mod-Ordner habe ich nämlich auch etwas in Verdacht, dass da auch was mit der MO2-Installation nicht...