Naja, du schreibst ja selbst "nervige Beschwerden wegen Inkompatibilität" und diese gibt es nunmal öfter, wenn Licht- und Wettermods (vor allem Wetter) nicht am Ende der Ladereihenfolge sind. Klar, ist das auch abhängig von den individuellen Ladelisten, keine Frage. Aber seit F3 und FNV hat sich diese Vorgehensweise bewährt und das wird, wie dir ja bekannt ist, meist von den Autoren auch schlicht "gefordert".
Also nehme ich "falsch" zurück und schreibe, Boss ordnet das oftmals ungünstig und manuell sollte man da nachbessern. ^^